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Marcel Caraciolo @marcelcaraciolo


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Como Python nos ajudou a interpretar o genoma humano de milhares de brasileiros

Python é uma poderosa linguagem de programação que já vem sido utilizada em vários nichos acadêmicos e empresariais.  Especialmente no âmbito comercial, ela é poderosa para construção de aplicativos web, desktop e científicos para inúmeros propósitos.  Em nosso laboratório de diagnósticos clínicos , Genomika Diagnósticos, onde atuamos com sequenciamento de DNA para detecção de doenças raras, tumores e cânceres, temos um grande desafio na análise de dados genéticos humanos para identificação e interpretação de variantes raras que podem explicar a suspeita clínica do paciente. São terabytes de dados consumidos e analisados mensalmente que nos exigiu "pensar fora da caixa" para solucionar vários desafios diários: desde a gestão do ciclo de vida de um exame no laboratório , gestão de equipamentos e robôs e até a análise de dados genéticos cruzadas mais de 50 bases de dados.


Python junto a outras linguagens em nosso set de desenvolvimento permitiu que nosso laboratório, com um time pequeno, pudesse desenvolver soluções científicas para atender os clientes internos e externos com oferta de ferramentas de bioinformática e gestão para inúmeras tarefas. O objetivo desta palestra é compartilhar como Python nos ajudou a escalar na interpretação de dados e automatizou vário de nossos fluxos laboratoriais. Será uma experiência enriquecidora ao público para aprender mais sobre aplicação de Python em Big Data na área de saúde e genômica.

Como Python nos ajudou a interpretar o genoma humano de milhares de brasileiros 

Python é uma poderosa linguagem de programação que já vem sido utilizada em vários nichos acadêmicos e empresariais.  Especialmente no âmbito comercial, ela é poderosa para construção de aplicativos web, desktop e científicos para inúmeros propósitos.  Em nosso laboratório de diagnósticos clínicos , Genomika Diagnósticos, onde atuamos com sequenciamento de DNA para detecção de doenças raras, tumores e cânceres, temos um grande desafio na análise de dados genéticos humanos para identiicação e interpretação de variantes raras que podem explicar a suspeita clínica do paciente. São terabytes de dados consumidos e analisados mensalmente que nos exigiu "pensar fora da caixa" para solucionar vários desafios diários: desde a gestão do ciclo de vida de um exame no laboratório , gestão de equipamentos e robôs e até a análise de dados genéticos cruzadas mais de 50 bases de dados.


Python junto a outras linguagens em nosso set de desenvolvimento permitiu que nosso laboratório, com um time pequeno, pudesse desenvolver soluções científicas para atender os clientes internos e externos com oferta de ferramentas de bioinformática e gestão para inúmeras tarefas. O objetivo desta palestra é compartilhar como Python nos ajudou a escalar na interpretação de dados e automatizou vário de nossos fluxos laboratoriais. Será uma experiência enriquecidora ao público para aprender mais sobre aplicação de Python em Big Data na área de saúde e genômica.